Новые усилия по улучшению качества антител помогут преодолеть кризис воспроизводимости в науке
Учёные обращают внимание на проблемы, связанные с использованием антител в биологических исследованиях, после того как было установлено, что многие коммерчески доступные антитела не работают должным образом. Это открытие вызывает опасения по поводу кризиса воспроизводимости, затрагивающего весь научный мир, затрудняя разработку новых лекарств и замедляя научные открытия.
Откуда берутся антитела и как они используются
Антитела — это белки, которые вырабатываются иммунной системой в ответ на чуждые вещества, такие как вирусы и бактерии. В лабораториях учёные используют антитела для специфической маркировки или количественной оценки определённых молекул, например, сегментов белков. Однако, для того чтобы антитела были эффективными, они должны обладать двумя ключевыми свойствами: специфичностью (способностью связываться только с целевым белком) и селективностью (недопущением связывания с другими молекулами).
- Специфичность: Сильное сродство к целевому белку.
- Селективность: Способность не связываться с другими белками.
Проблемы с качеством антител
Исследование, проведённое Карлом Лафламом, постдокторантом Монреальского неврологического института, выявило, что из 16 протестированных коммерческих антител лишь три продемонстрировали хорошие характеристики. Однако, удивительно, что ни одно из этих антител не использовалось в опубликованных исследованиях, несмотря на то, что более 15 работ ссылались на антитела, которые не связывались с изучаемым белком.
«В полях было много путаницы», — говорит Лафлам, подчеркивая, что такая ненадежность приводит к потере времени и ресурсов и затрудняет воспроизводимость экспериментов.
Инициативы по улучшению качества антител
Лафлам и его коллеги разработали инициативу под названием Antibody Characterization through Open Science (YCharOS), целью которой является оценка коммерчески доступных антител для всех белков человека. Взаимодействие с производителями антител стало ключевым моментом в этом проекте: более дюжины компаний согласились предоставить свои антитела для тестирования.
Результаты последнего анализа YCharOS показали, что около двух третей протестированных антител не соответствовали заявленным характеристикам. В ответ на это, более половины из них были пересмотрены производителями, и 73 антитела были сняты с рынка.
Новые подходы и технологии
Существуют также другие инициативы, направленные на улучшение качества антител. Например, Органные панели антител (OMAPs) включают в себя сообщества, которые проверяют антитела в различных контекстах, что помогает более глубоко понять их работу в разных тканях и условиях.
Анализ данных приводит к осознанию, что значительное количество антител невозможно протестировать на всех возможных приложениях. Поэтому сообщества учёных и производителей работают вместе, чтобы улучшать качество антител и внедрять новые стандарты в области их использования.
Проблема идентификации антител
Другой аспект, усугубляющий ситуацию, связан с тем, как ученые представляют и идентифицируют антитела в своих публикациях. Исследования показали, что около 90% антител, упомянутых в научных статьях, не имели каталожного номера, что затрудняет их отслеживание. В ответ на это была разработана система уникальных идентификаторов для антител, которая помогает решить проблему идентификации.
Будущее антител в научных исследованиях
Производители антител также начали улучшать свою продукцию, переходя на рекомбинантные антитела, которые обеспечивают стабильность и воспроизводимость. Эти антитела создаются в генетически модифицированных клетках и обеспечивают более высокое качество, чем традиционные методы. Такая трансформация в производстве уже начала давать свои плоды, и учёные надеются на дальнейшие улучшения.